Pierwsza wzmianka o Pajtuńskim Młynie pochodzi z 26.01.1374r. Wtedy kapituła warmińska nadała  przywilej lokacyjny dla wsi Pajtuny. Co prawda nie istnieje jeszcze wtedy nazwa Pajtuński Młyn, lecz funkcjonuje majątek związany z młynem jako osobna osada.

W roku 1486 administrator kapituły zwolnił młynarza Sandera na 8 lat od opłat czynszowych w zamian za to, że wyposaży młyn w nowe koło wodne. W czasie wojny szwedzkiej w roku 1655 został spalony i odbudowany dopiero 5 lat później. Na przestrzeni wieków cała posiadłość przeżywała stan świetności i upadków. W dniu 22.01.1945r. młyn obsadzony był przez załogę wermachtu i broniony kosztem dużych strat. Po wojnie młyn został przejęty przez państwo i do 1983roku był użytkowany przez Spółdzielnię Kółko Rolnicze w Purdzie.

W roku 1991 nowi właściciele zakładają spółkę, której celem było utworzenie ośrodka hotelowo-rekreacyjnego. Niestety cały kompleks Pajtuńskiego Młyna pozostaje bez opiekuna i ulega systematycznej grabieży i dewastacji. W roku 2004 stan gospodarstwa (ziemi i budynków) jest opłakany. Powybijane okna, itd., przykro pisać.

Od 26.III.2004r. posiadłość Pajtuński Młyn należy do nas i powoli przywracamy jej dawny blask.

Pensjonat kiedyś (2004)

Pensjonat dzisiaj